Cибирский голец — характерно донная рыба, ведущая кочевой образ жизни. Выбирает места с холодной и быстрой водой, каменистыми и галечными грунтами, хоть и не слишком прихотлив к качеству воды. Водится в заливах Кузбасских рек с невысокой проточностью, способен существовать в заиленных прудах с теплой водой. При пересыхании водоема или его промерзании может закапываться в грунт и пережидать неблагоприятное время года.

Немалую часть жизни проводит, скрываясь под камнями, корягами, среди растительности, в норках и иных укрытиях или закапывается в грунт. Днем скрывается под различными объектами, лежащими на дне. Держится в одиночку либо малыми группами.

Половозрелым голец делается в возрасте 3 лет. Нерестится он в конце мая и в июне в верховьях больших и малых притоков Енисея на перекатах, откладывая икру на галечные грунты, песок или растительность. Нерест порционный. Икра мелкая, клейкая. Плодовитость самки сибирского гольца при длине 136 мм и массе 22 г мала и составляет всего 800 икринок.

Пищу гольца составляют донные организмы: личинки ручейников, поденок, веснянок, хирономид и икра рыб. Кормится в основном в сумерках и ночью. Сибирский голец является значительным пищевым предметом для осетра, налима, хариуса и щуки.